亚博投注

醫食學院李代禧參與研發的華為生物信息研究平臺“鵬程.神農”重磅發布

時間: 2021-09-29瀏覽: 97編輯: 董真攝影: ????通訊員: 設置

9月25日,在華為全聯接2021線上大會上,作為國家戰略科技力量重要組成部分的廣東鵬城實驗室發布了面向生物醫學領域的AI大模型——鵬程.神(shen)農生(sheng)物信息研究平臺(簡稱“鵬程.神農”),以期利用(yong)人工智能賦能生物醫藥探索,加速新型藥物篩選與創制,開(kai)啟(qi)“AI+制藥”時代。這是鵬城實驗室在今年5月(yue)發布業界首個兩千億級中文自然語言處(chu)理(NLP)AI大模型“鵬程.盤古”之后(hou)的(de)又一嶄新成果。

病毒和(he)細(xi)菌隨著生物的進化變得愈加復雜,鵬城(cheng)實(shi)驗室基于“鵬城(cheng)云腦(nao)II”超大規模AI算力集(ji)群和(he)昇思AI框(kuang)架打造的“鵬程.神農”,包(bao)含蛋白質結構(gou)預(yu)測(ce)、小(xiao)分子生成、靶點與(yu)小(xiao)分子相互作用(yong)預(yu)測(ce)、新抗菌多肽設計與(yu)效果評價等模塊。制藥企業和(he)醫學研(yan)究機構(gou)可(ke)以使用(yong)“鵬程.神農”提供的(de)(de)AI能(neng)力,加速新型藥物的(de)(de)篩選與(yu)創(chuang)制,讓(rang)人工智能(neng)為人類的(de)(de)健康保駕護航。

在前期的抗(kang)病(bing)(bing)(bing)毒(du)(du)多(duo)肽(人腸(chang)防御素5(HD5)、抗(kang)菌抗(kang)病(bing)(bing)(bing)毒(du)(du)肽LL37等)相關研究中(zhong),亚博(bo)投注醫食學院(yuan)李(li)代(dai)禧老師參與(yu)了“鵬程(cheng).神(shen)農”這一重大科研平臺(tai)的項目(mu)研發。在國內(nei)頂級同行通(tong)過人工智能設計(ji)的眾多(duo)候選多(duo)肽的基礎上,李(li)代(dai)禧依次進行多(duo)肽三維結(jie)(jie)構預測、多(duo)肽與(yu)病(bing)(bing)(bing)毒(du)(du)蛋白(bai)受體分(fen)子對接、分(fen)子動力學模擬、多(duo)肽與(yu)病(bing)(bing)(bing)毒(du)(du)蛋白(bai)受體的結(jie)(jie)合(he)自(zi)由能計(ji)算,通(tong)過綜合(he)評價(jia)、分(fen)析和驗證了多(duo)肽藥物(wu)的抗(kang)新冠病(bing)(bing)(bing)毒(du)(du)效果。

 

多肽抑制(zhi)劑和(he)新冠病毒突(tu)刺糖蛋白RBD結(jie)構域的(de)結(jie)合(he)示(shi)意圖

(紅色U螺旋及表(biao)(biao)面是李代禧自行設計(ji)的(de)多肽抑(yi)制劑,彩色條帶和白(bai)(bai)色分子表(biao)(biao)面代表(biao)(biao)是新冠病(bing)毒突刺糖蛋白(bai)(bai)RBD結構(gou)域(yu))


與國內外同類方法相比,李代禧自主開發的多肽抗病毒活性評價算法凸顯了快速、準確、高效的方法特點: 他用半個月時間成功完成以往需耗時半年的分子模擬任務,且經抗新冠多肽評價算法篩選的多肽100%具有抗病毒活性且抗病毒活性均達到了較高水平。作為藥物研發的關鍵環節,李代禧所做工作為“鵬程.神農”平臺的構建提供了重大支(zhi)撐。 


【相(xiang)關】

醫(yi)食學(xue)(xue)院李代禧(xi)(xi)老(lao)師為中(zhong)國計算(suan)(suan)生(sheng)物學(xue)(xue)與生(sheng)物信息學(xue)(xue)專業(ye)委員會常務委員,長期從事計算(suan)(suan)生(sheng)物學(xue)(xue)研究,專注藥(yao)(yao)物篩(shai)選(xuan)和(he)(he)設計方向,在冰晶(jing)及(ji)藥(yao)(yao)物的(de)可控結晶(jing)和(he)(he)晶(jing)形(xing)調(diao)控、蛋白藥(yao)(yao)物的(de)活性(xing)保護(hu)方面(mian)均(jun)有成果。曾獲中(zhong)國機械工業(ye)科(ke)學(xue)(xue)技術(shu)獎(jiang)(jiang)二等獎(jiang)(jiang)和(he)(he)上(shang)海市科(ke)學(xue)(xue)技術(shu)獎(jiang)(jiang)三等獎(jiang)(jiang)。在國際權威期刊《胃(wei)腸病學(xue)(xue)》(Gastroenterology,TOP1區,IF=18.785,H-Index=368,入全球生(sheng)命(ming)科(ke)學(xue)(xue)領域F1000)、《美國化(hua)學(xue)(xue)學(xue)(xue)會—傳(chuan)染(ran)性(xing)疾病》(ACS Infectious Diseases)、《交叉科(ke)學(xue)(xue): 計算(suan)(suan)生(sheng)命(ming)科(ke)學(xue)(xue)》(Interdisciplinary Sciences: Computational Life Sciences)等上(shang)發(fa)表多篇高(gao)質量抗新冠病毒(du)(du)論(lun)文。目前,李代禧(xi)(xi)正致力于基于人(ren)工智能算(suan)(suan)法和(he)(he)傳(chuan)統優(you)勢算(suan)(suan)法的(de)抗病毒(du)(du)藥(yao)(yao)物篩(shai)選(xuan)和(he)(he)全新設計。


供(gong)稿: 醫食學院、新聞(wen)中心


返回(hui)原圖(tu)
/

亚博投注