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醫食學院李代禧參與研發的華為生物信息研究平臺“鵬程.神農”重磅發布

時間: 2021-09-29瀏覽: 928編輯: 董真攝影: ????通訊員: 設置

9月25日,在華為全聯接2021線上大會上,作為國家戰略科技力量重要組成部分的廣東鵬城實驗室發布了面向生物醫學領域的AI大模型——鵬程.神(shen)農生物信息研究平(ping)臺(簡稱“鵬程.神農”),以期利用人工智能賦能生物醫藥(yao)(yao)(yao)探(tan)索,加(jia)速新型(xing)藥(yao)(yao)(yao)物篩(shai)選與創制,開啟“AI+制藥(yao)(yao)(yao)”時代。這是鵬(peng)城實(shi)驗(yan)室在今(jin)年5月(yue)發(fa)布業界首個(ge)兩千億級中文自然語言處理(NLP)AI大模(mo)型(xing)“鵬(peng)程(cheng).盤(pan)古”之后的(de)又一嶄新成(cheng)果(guo)。

病毒和細(xi)菌隨著生物的進(jin)化變得愈(yu)加復雜,鵬(peng)城(cheng)實驗室基于(yu)“鵬(peng)城(cheng)云腦II”超(chao)大(da)規模AI算力集群(qun)和昇思AI框(kuang)架打造的“鵬(peng)程.神農”,包含蛋(dan)白質結構預(yu)測、小(xiao)分(fen)子(zi)生成(cheng)、靶點與(yu)小(xiao)分(fen)子(zi)相(xiang)互(hu)作用(yong)預(yu)測、新(xin)抗菌(jun)多肽設計與(yu)效果評(ping)價(jia)等(deng)模塊。制(zhi)藥(yao)企業和醫學研究機構可以使用(yong)“鵬程(cheng).神農(nong)”提供(gong)的(de)AI能力,加速新(xin)型(xing)藥(yao)物的(de)篩選與(yu)創制(zhi),讓人(ren)工智能為人(ren)類的(de)健康保駕護航(hang)。

在(zai)前(qian)期的抗(kang)病毒(du)多(duo)(duo)(duo)肽(tai)(人腸防(fang)御素5(HD5)、抗(kang)菌抗(kang)病毒(du)肽(tai)LL37等)相關研(yan)究中,亚博投注(zhu)醫食學院李代禧(xi)老師參(can)與(yu)(yu)(yu)了“鵬程(cheng).神農”這一(yi)重大科(ke)研(yan)平(ping)臺的項目研(yan)發。在(zai)國內頂級同行通(tong)過人工智(zhi)能(neng)設計的眾多(duo)(duo)(duo)候選多(duo)(duo)(duo)肽(tai)的基礎上(shang),李代禧(xi)依(yi)次進行多(duo)(duo)(duo)肽(tai)三維結(jie)構預測、多(duo)(duo)(duo)肽(tai)與(yu)(yu)(yu)病毒(du)蛋白受(shou)體分子對接、分子動(dong)力學模擬、多(duo)(duo)(duo)肽(tai)與(yu)(yu)(yu)病毒(du)蛋白受(shou)體的結(jie)合自由能(neng)計算,通(tong)過綜(zong)合評價、分析和(he)驗證了多(duo)(duo)(duo)肽(tai)藥物(wu)的抗(kang)新冠(guan)病毒(du)效果。

 

多肽抑(yi)制劑(ji)和新冠病毒突刺(ci)糖蛋白RBD結(jie)構域的結(jie)合示(shi)意(yi)圖

(紅(hong)色U螺旋及(ji)表(biao)面是李(li)代(dai)禧自(zi)行(xing)設計的多肽抑制(zhi)劑(ji),彩色條(tiao)帶和白色分子表(biao)面代(dai)表(biao)是新冠病毒突刺糖蛋白RBD結構域)


與國內外同類方法相比,李代禧自主開發的多肽抗病毒活性評價算法凸顯了快速、準確、高效的方法特點: 他用半個月時間成功完成以往需耗時半年的分子模擬任務,且經抗新冠多肽評價算法篩選的多肽100%具有抗病毒活性且抗病毒活性均達到了較高水平。作為藥物研發的關鍵環節,李代禧所做工作為“鵬程.神農”平臺(tai)的構(gou)建(jian)提供(gong)了(le)重大支撐。 


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醫食(shi)學(xue)(xue)院李(li)代(dai)禧老(lao)師為中國計算(suan)(suan)生物(wu)學(xue)(xue)與生物(wu)信(xin)息(xi)學(xue)(xue)專(zhuan)業(ye)委(wei)員(yuan)會常務(wu)委(wei)員(yuan),長期從事計算(suan)(suan)生物(wu)學(xue)(xue)研(yan)究,專(zhuan)注藥物(wu)篩選和設計方向,在(zai)(zai)冰晶(jing)及藥物(wu)的(de)可控(kong)結晶(jing)和晶(jing)形調控(kong)、蛋白藥物(wu)的(de)活性保(bao)護(hu)方面均有成果。曾獲中國機械工業(ye)科學(xue)(xue)技術獎(jiang)二等(deng)獎(jiang)和上(shang)海市(shi)科學(xue)(xue)技術獎(jiang)三等(deng)獎(jiang)。在(zai)(zai)國際(ji)權威期刊《胃腸(chang)病學(xue)(xue)》(Gastroenterology,TOP1區(qu),IF=18.785,H-Index=368,入全球生命(ming)科學(xue)(xue)領域F1000)、《美國化學(xue)(xue)學(xue)(xue)會—傳染性疾病》(ACS Infectious Diseases)、《交叉科學(xue)(xue): 計算(suan)(suan)生命(ming)科學(xue)(xue)》(Interdisciplinary Sciences: Computational Life Sciences)等(deng)上(shang)發表(biao)多篇高質量抗新冠病毒論文。目(mu)前,李(li)代(dai)禧正致力于基于人工智能算(suan)(suan)法(fa)(fa)和傳統優勢(shi)算(suan)(suan)法(fa)(fa)的(de)抗病毒藥物(wu)篩選和全新設計。


供稿: 醫食學院、新聞中心


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